Japeri pertence à Região Metropolitana, que também abrange os municípios de Rio de Janeiro, Belford Roxo, Duque de Caxias, Guapimirim, Itaboraí, Magé, Mesquita, Nilópolis, Niterói, Nova Iguaçu, Paracambi, Queimados, São Gonçalo, São João de Meriti, Seropédica e Tanguá.
O município tem um único distrito-sede, ocupando uma área total 2 de 81,4 quilômetros quadrados, correspondentes a 1,7% da área da Região Metropolitana. Japeri alcança a Via Dutra em Seropédica, ao sul, pela RJ-125, que segue rumo norte para Miguel Pereira, enquanto a RJ-093 liga a localidade de Engenheiro Pedreira ao município de Queimados, a sudeste. É um importante entroncamento ferroviário.
De acordo com o censo de 2000, Japeri tinha uma população de 83.278 habitantes, correspondentes a 0,8% do contingente da Região Metropolitana, com uma proporção de 98,4 homens para cada 100 mulheres. A densidade demográfica era de 1.075 habitantes por km2, contra 2.380 habitantes por km2 de sua região. Sua população estimada em 2006 3 é de 96.209 pessoas.
O município apresentou 4 uma taxa média geométrica de crescimento, no período de 1991 a 2000, de 2,67% ao ano, contra 1,17% na região e 1,30% no Estado. Sua taxa de urbanização corresponde a 100,0% da população, enquanto que, na Região Metropolitana, tal taxa corresponde a 99,5%.
Japeri tem um contingente de 58.769 eleitores 5, correspondentes a 61% do total da população. O município tem um número total de 27.052 domicílios 6, com uma taxa de ocupação de 85%. Dos 3.998 domicílios não ocupados, 10% têm uso ocasional.
Rio dos Poços:
O Rio dos Poços, formado pela confluência dos rios Santo Antônio e D’Ouro, faz a divisa dos municípios de Queimados e Japeri até a faixa da linha de transmissão. A partir daí passa a fazer a divisa entre os municípios de Queimados e Seropédica.
Rio São Pedro
A bacia do rio São Pedro, além de ser menor (95 km²), tem a maior parte de sua área inserida nas florestas da Serra do Tinguá (Figura 4.8). No terço inferior desta bacia, onde as terras são planas, observa-se uma extensa área de uso agrícola, que no mapa do Macroplano constava como área de campo/pastagem. Nas encostas situadas à margem direita deste trecho (que faz divisa com a bacia do rio Santana), capoeiras e florestas foram substituídas por pastagens. Este trecho da margem direita do rio São Pedro é uma ponta do município de Nova Iguaçu (localidade de Jaceruba), inserida entre os municípios de Miguel Pereira e Japeri.
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